Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Ascl4M0QW46 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ascl4M0QW46 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms