Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP2

Gm3685, Predicted gene 3685, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3685J3QPP2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3685J3QPP2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3685J3QPP2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3685J3QPP2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3685J3QPP2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3685J3QPP2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3685J3QPP2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3685J3QPP2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3685J3QPP2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3685J3QPP2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3685J3QPP2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3685J3QPP2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3685J3QPP2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3685J3QPP2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3685J3QPP2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms