Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21797J3QNW5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21797J3QNW5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms