Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm10428J3QNV7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm10428J3QNV7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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