Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3336J3QMQ6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm3336J3QMQ6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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