Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm21818J3KMS6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms