Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r67G5E8C1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r67G5E8C1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms