Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc9a3G3X939 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc9a3G3X939 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms