Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
BicraF8VPZ9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
BicraF8VPZ9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
BicraF8VPZ9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
BicraF8VPZ9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
BicraF8VPZ9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
BicraF8VPZ9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
BicraF8VPZ9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
BicraF8VPZ9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
BicraF8VPZ9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
BicraF8VPZ9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
BicraF8VPZ9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
BicraF8VPZ9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
BicraF8VPZ9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
BicraF8VPZ9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
BicraF8VPZ9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
BicraF8VPZ9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
BicraF8VPZ9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
BicraF8VPZ9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC35.45■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
BicraF8VPZ9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
BicraF8VPZ9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
BicraF8VPZ9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms