Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ercc6F8VPZ5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Ercc6F8VPZ5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ercc6F8VPZ5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ercc6F8VPZ5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ercc6F8VPZ5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ercc6F8VPZ5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ercc6F8VPZ5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ercc6F8VPZ5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ercc6F8VPZ5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ercc6F8VPZ5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ercc6F8VPZ5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ercc6F8VPZ5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ercc6F8VPZ5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ercc6F8VPZ5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ercc6F8VPZ5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ercc6F8VPZ5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ercc6F8VPZ5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ercc6F8VPZ5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ercc6F8VPZ5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ercc6F8VPZ5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ercc6F8VPZ5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ercc6F8VPZ5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ercc6F8VPZ5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms