Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP0

Zfp708, Zinc finger protein 708, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp708F8VPP0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp708F8VPP0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp708F8VPP0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms