Protein–RNA interactions for Protein: F7AXR3

Gm17654, Predicted gene, 17654 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17654F7AXR3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17654F7AXR3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17654F7AXR3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17654F7AXR3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17654F7AXR3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17654F7AXR3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17654F7AXR3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17654F7AXR3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17654F7AXR3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms