Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
D430041D05RikF6ZGR6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
D430041D05RikF6ZGR6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
D430041D05RikF6ZGR6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms