Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5218F6YH22 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5218F6YH22 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms