Protein–RNA interactions for Protein: F6W3F3

Gm21974, Predicted gene 21974 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21974F6W3F3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21974F6W3F3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21974F6W3F3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms