Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5861F6VCN9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5861F6VCN9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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