Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TrdnE9Q9K5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TrdnE9Q9K5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms