Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col22a1E9Q7P1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Col22a1E9Q7P1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms