Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BC005561E9Q5E2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BC005561E9Q5E2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
BC005561E9Q5E2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms