Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms