Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdr1E9Q0B4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdr1E9Q0B4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdr1E9Q0B4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdr1E9Q0B4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdr1E9Q0B4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdr1E9Q0B4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdr1E9Q0B4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdr1E9Q0B4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdr1E9Q0B4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdr1E9Q0B4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms