Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm9972E9Q053 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9972E9Q053 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms