Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E430018J23RikE9PZQ8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms