Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gcom1E9PZ54 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcom1E9PZ54 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms