Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp4E9PYK3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp4E9PYK3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Parp4E9PYK3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Parp4E9PYK3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Parp4E9PYK3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp4E9PYK3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms