Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifit3bE9PV48 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifit3bE9PV48 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms