Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp6ap1lD3Z5W0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp6ap1lD3Z5W0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms