Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
4930407I10RikD3Z5T8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
4930407I10RikD3Z5T8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
4930407I10RikD3Z5T8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
4930407I10RikD3Z5T8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
4930407I10RikD3Z5T8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
4930407I10RikD3Z5T8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
4930407I10RikD3Z5T8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
4930407I10RikD3Z5T8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
4930407I10RikD3Z5T8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
4930407I10RikD3Z5T8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
4930407I10RikD3Z5T8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
4930407I10RikD3Z5T8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
4930407I10RikD3Z5T8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms