Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kif28pD3YXS5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kif28pD3YXS5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms