Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc170D3YXL0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc170D3YXL0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms