Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc13D3YV10 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc13D3YV10 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms