Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700015F17RikD3YUK8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700015F17RikD3YUK8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms