Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf11bB4XVQ1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf11bB4XVQ1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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