Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rd3lB2RV38 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms