Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1B2KF50 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms