Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2012B1B0R1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2012B1B0R1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms