Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r232A2RTT5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r232A2RTT5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r232A2RTT5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r232A2RTT5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r232A2RTT5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r232A2RTT5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r232A2RTT5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r232A2RTT5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r232A2RTT5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r232A2RTT5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r232A2RTT5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r232A2RTT5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms