Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SktA2AQ25 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SktA2AQ25 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms