Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyb561d1A2AE42 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms