Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Prdm2A2A7B5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prdm2A2A7B5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prdm2A2A7B5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms