Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul4bA2A432 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul4bA2A432 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms