Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSB3

Gm3880, Predicted pseudogene 3880, mousemouse

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Length 72 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3880A0A1B0GSB3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3880A0A1B0GSB3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
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Gm3880A0A1B0GSB3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Gm3880A0A1B0GSB3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm3880A0A1B0GSB3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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