Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700028J19RikA0A0U1RP08 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms