Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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