Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5114W4VSN8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm5114W4VSN8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5114W4VSN8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms