Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vstm4T1NXB5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms