Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn8Q9Z260 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn8Q9Z260 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms