Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccne2Q9Z238 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccne2Q9Z238 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccne2Q9Z238 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms