Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L1

S1pr4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1pr4Q9Z0L1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1pr4Q9Z0L1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
S1pr4Q9Z0L1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1pr4Q9Z0L1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms