Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pmfbp1Q9WVQ0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms